过滤纯净水的逆渗透膜虽然去除了水中的细菌杂质，但也把水中的对人体有益的微量元素过滤掉了，长期饮用会导人体的微量元素缺乏，引起少年儿童发育不良,引起老年人的各种微量元素缺乏症。

正规水厂出产的矿泉水和纯净水中一般不含防腐物质。国家标准方法（GB8537—2008）对饮用矿泉水的感官性状、多重离子含量指标、化学性污染物含量指标和微生物学指标有规定，并未对水中防腐剂含量做出规定。瓶装水没有必要添加防腐剂，在盛水容器密封的情况下，外界的空气和微生物不可能进入容器内部。水开封的情况下，空气和微生物都与水发生接触，利于细菌微生物的生长。因此，在开封的情况下，纯净水和矿泉水的保质期在15天左右。

一般而言无机矿物进入地表水和地下水通过雨水径流或通过地壳，使水中包括钙，锌，锰，磷，氟和钠的化合物。从水产生的营养物质提供了一些节肢动物和沙漠动物的日常用水需求的一个重要部分，但只提供一小部分的人的必要的摄入量，因此并无科学依据不能长期饮用纯净水。但过度饮水也会导致水‘中毒（导致低钠血症）。